Las plantas albergan una gran variedad de agentes infecciosos que con frecuencia causan daños en los cultivos y los ecosistemas naturales. El objetivo de nuestro grupo de investigación es comprender la interacción entre las plantas y algunos de estos patógenos, como virus y viroides, a nivel molecular. A partir de este conocimiento, buscamos desarrollar nuevas estrategias biotecnológicas para la protección e innovación en los cultivos. Además, basándonos en las notables propiedades biológicas de los virus y viroides de plantas, creemos que estos agentes infecciosos pueden ser reutilizados como herramientas biotecnológicas útiles. Nuestro objetivo también es desarrollar sistemas sintéticos para producir proteínas recombinantes, nanopartículas, metabolitos y ARN recombinante de interés en plantas utilizando virus y viroides modificados convenientemente. Imaginamos un futuro en el que las plantas cultivadas serán la fuente más fiable y sostenible de alimentos, forrajes, fibras, combustibles y productos farmacéuticos y químicos para la humanidad.

Más concretamente, algunos de nuestros proyectos en curso tienen como objetivo:

1. Desarrollar vectores de expresión basados en virus para facilitar la edición genómica mediante CRISPR-Cas en plantas. Véase Uranga et al. 2024 *Hortic. Res.* o Aragonés et al. 2022 *Biotechnol. J.*

2. Producir nanopartículas derivadas de virus decoradas con moléculas de interés, como anticuerpos, en plantas biofactoría. Véase Lozano-Sánchez et al. 2024 *ACS Nano* o Merwaiss et al. 2023 *Plant Biotechnol. J.*

3. Producir ARN de doble cadena recombinante para la protección de cultivos frente a plagas y patógenos. Véase Ortolá et al. 2024 *Pest Manag. Sci.* u Ortolá et al. 2021 *RNA Biol.*

4. Desarrollar vectores virales para la producción de proteínas recombinantes en plantas. Véase Talens-Perales et al. 2023 *Curr. Res. Biotechnol.* o Talens-Perales et al. 2022 *Sci. Rep.*

5. Obtener plantas y frutos enriquecidos metabólicamente utilizando vectores virales. Véase Houhou et al. 2022 *Biotechnol. J.* o Martí et al. 2020 *Metab. Eng.*

6. Desentrañar cómo los ARN de virus y viroides son capaces de replicarse, superar las defensas y moverse de forma sistémica por las plantas huésped. Véase Ortolá & Daròs 2022 *Biology.*

Nuestro grupo forma parte del Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas (IBMCP), un centro mixto del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y la Universitat Politècnica de València (UPV).

161) Talens-Perales D., J.A. Daròs, J. Polaina and J. Marín-Navarro (2025)
Synergistic enzybiotic effect of a bacteriophage endolysin and an engineered glucose oxidase against listeria
Biomolecules, 15 (1): 24, DOI: 10.3390/biom15010024 Clave: A

160) Lozano-Sanchez E., J.A. Daròs and F. Merwaiss (2024)
Production of plant virus-derived hybrid nanoparticles decorated with different nanobodies
ACS Nano, 18 (50): 33890-33906, DOI: 10.1021/acsnano.4c07066 Clave: A

159) Eiras M., V. Aragonés, J. Marqués, M.D. Gómez and J.A. Daròs (2024)
Eggplant latent viroid is located in the chloroplasts and nuclei of eggplant infected cells
Virology Journal, 21 (1): 254, DOI: 10.1186/s12985-024-02530-8 Clave: A

158) Morote L., A. Rubio-Moraga, A.J. López Jiménez, V. Aragonés, G. Diretto, O. Dermutas, S. Frusciante, O. Ahrazem, J.A. Daròs and L. Gómez-Gómez (2024)
Verbascum species as a new source of saffron apocarotenoids and molecular tools for the biotechnological production of crocins and picrocrocin
Plant Journal, 118 (1): 58-72, DOI: 10.1111/tpj.16589 Clave: A

157) Merwaiss F., E. Lozano-Sanchez, J. Zulaica, L. Rusu, M. Vazquez-Vilar, D. Orzáez, G. Rodrigo, R. Geller and J.A. Daròs (2024)
Plant virus-derived nanoparticles decorated with genetically encoded SARS-CoV-2 nanobodies display enhanced neutralizing activity
Plant Biotechnology Journal, 22 (4): 876-891, DOI: 10.1111/pbi.14230 Clave: A

156) Ortolá B., A. Urbaneja, M. Eiras, M. Pérez-Hedo and J.A. Daròs (2024)
RNAi-mediated silencing of Mediterranean fruit fly (Ceratitis capitata) endogenous genes using orally-supplied double-stranded RNAs produced in Escherichia coli
Pest Management Science, 80 (3): 1087-1098, DOI: 10.1002/ps.7839 Clave: A

155) Ortolá B. and J.A. Daròs (2024)
RNA interference in insects: from a natural mechanism of gene expression regulation to a biotechnological crop protection promise
Biology, 13 (3): 137, DOI: 10.3390/biology13030137 Clave: R

154) Uranga M., V. Aragonés, A. García, S. Mirabel, S. Gianoglio, S. Presa, A. Granell, F. Pasin and J.A. Daròs (2024)
RNA virus-mediated gene editing for tomato trait breeding
Horticulture Research, 11 (1): uhad279, DOI: 10.1093/hr/uhad279 Clave: A

153) J.A. Daròs (2024)
Future perspectives in viroid research
In Fundamentals of Viroid Biology, 397-407, DOI: 10.1016/B978-0-323-99688-4.00018-3 Clave: CL

152) Cisneros A.E., T. Martín-García, A. Primc, W. Kuziuta, J. Sánchez-Vicente, V. Aragonés, J.A. Daròs and A. Carbonell (2023)
Transgene-free, virus-based gene silencing in plants by artificial microRNAs derived from minimal precursors
Nucleic Acids Research, 51 (19): 10719-10736, DOI: 10.1093/nar/gkad747 Clave: A

151) Talens-Perales D., M. Nicolau-Sanus, J. Marín-Navarro, J. Polaina and J.A. Daròs (2023)
Production in Nicotiana benthamiana of a thermotolerant glucose oxidase that shows enzybiotic activity against Escherichia coli and Staphylococcus aureus
Current Research in Biotechnology, 6: 100148, DOI: 10.1016/j.crbiot.2023.100148 Clave: A

150) Márquez-Costa R., R. Montagud-Martínez, M.C. Marqués, E. Albert, D. Navarro, J.A. Daròs, R. Ruiz and G. Rodrigo (2023)
Multiplexable and biocomputational virus detection by CRISPR-Cas9-mediated strand displacement
Analytical Chemistry, 95 (25): 9564-9574, DOI: 10.1021/acs.analchem.3c01041 Clave: A

149) Demurtas O.C., M. Sulli, P. Ferrante, P. Mini P, M. Martí, V. Aragonés, J.A. Daròs and G. Giuliano (2023)
Production of saffron apocarotenoids in Nicotiana benthamiana plants genome-edited to accumulate zeaxanthin precursor
Metabolites, 13 (6): 729, DOI: 10.3390/metabo13060729 Clave: A

148) Uranga M. and J.A. Daròs (2022)
Tools and targets: the dual role of plant viruses in CRISPR-Cas genome editing
Plant Genome, 16 (2): e20220, DOI: 10.1002/tpg2.20220 Clave: R

147) Eiras M., A. Mota de Oliveira, A.F. Ramos, R. Harakava and J.A. Daròs (2023)
First report of citrus bark cracking viroid and hop latent viroid infecting hop in commercial yards in Brazil
Journal of Plant Pathology, DOI: 10.1007/s42161-023-01313-4 Clave: A

146) Daròs J.A., F. Pasín and F. Merwaiss (2023)
CRISPR-Cas-based plant genome engineering goes viral
Molecular Plant, 16 (4): 660-661, DOI: 10.1016/j.molp.2023.03.010 Clave: R

145) Uranga M., V. Aragonés, J.A. Daròs and F. Pasín (2023)
Heritable CRISPR-Cas9 editing of plant genomes using RNA virus vectors
Star Protocols, 4 (1): 102091, DOI: 10.1016/j.xpro.2023.102091 Clave: R

144) Cisneros A.E., P. Lisón, L. Campos, J.M. López-Tubau, T. Altabella, A. Ferrer, J.A. Daròs and A. Carbonell (2023)
Downregulation of tomato STEROL GLYCOSYLTRANSFERASE 1 perturbs plant development and facilitates viroid infection
Journal of Experimental Botany, 74 (5): 1564-1578, DOI: 10.1093/jxb/erac361 Clave: A

143) Ortolá, B. and J.A. Daròs (2023)
Viroids: non-coding circular RNAs able to autonomously replicate and infect higher plants
Biology (Basel), 12 (2): 172, DOI: 10.3390/biology12020172 Clave: R

142) Daròs J.A. (2022)
Vectores de expresión derivados de virus de plantasy viroides
Fitopatología, 8: 6-12 Clave: R

141) Talens-Perales D., M. Nicolau-Sanus, J. Polaina and J.A. Daròs (2022)
Expression of an extremophilic xylanase in Nicotiana benthamiana and its use for the production of prebiotic xylooligosaccharides
Scientific Reports, 12 (1): 15743, DOI: 10.1038/s41598-022-19774-5 Clave: A

140) Selma S., S. Gianoglio, M. Uranga, M. Vázquez-Vilar, A. Espinosa-Ruiz, A. Drapal, P.D. Fraser, J.A. Daròs and D. Orzaez (2022)
Potato virus X-delivered CRISPR activation programs lead to strong endogenous gene induction and transient metabolic reprogramming in Nicotiana benthamiana
Plant Journal, 111 (6): 1550-1564, DOI: 10.1111/tpj.15906 Clave: A

139) Marqués M.C., J. Sánchez-Vicente, R. Ruiz, R. Montagud-Martínez, R. Márquez-Costa, G. Gómez, A. Carbonell, J.A. Daròs and G. Rodrigo (2022)
Diagnostics of infections produced by the plant viruses TMV, TEV, and PVX with CRISPR-Cas12 and CRISPR-Cas13
ACS Synthetic Biology, 11 (7): 2384-2393, DOI: 10.1021/acssynbio.2c00090 Clave: A

138) Aragonés V., F. Aliaga, F. Pasin and J.A. Daròs (2022)
Simplifying plant gene silencing and genome editing logistics by a one-Agrobacterium system for simultaneous delivery of multipartite virus vectors
Biotechnology Journal, 17 (7): e2100504, DOI: 10.1002/biot.202100504 Clave: A

137) Pasin F., J.A. Daròs and I.E. Tzanetakis (2022)
Proteome expansion in the Potyviridae evolutionary radiation
FEMS Microbiology Reviews, 46 (4): fuac011, DOI: 10.1093/femsre/fuac011 Clave: R

136) Houhou F., M. Martí, T. Cordero, V. Aragonés, C. Sáez, J. Cebolla-Cornejo, A. Pérez de Castro A, M. Rodríguez-Concepción, B. Picó and J.A. Daròs (2022)
Carotenoid fortification of zucchini fruits using a viral RNA vector
Biotechnology Journal, 17 (5): e2100328, DOI: 10.1002/biot.202100328 Clave: A

135) Pallas V., C. Hernández, J.F. Marcos, J.A. Daròs, S. Ambrós, B. Navarro, J.A. Navarro, M. de la Peña, S. Gago-Zachert, M.E. Gas, A. Carbonell, C. Lopez, A.E. Martínez de Alba, F. Di Serio and P. Moreno (2022)
In Memoriam of Ricardo Flores: The Career, Achievements, and Legacy of an inspirational plant virologist
Virus Research, 312: 198718, DOI: 10.1016/j.virusres.2022.198718 Clave: R

134) Rodriguez-Concepcion M. and J.A. Daròs (2022)
Transient expression systems to rewire plant carotenoid metabolism
Current Opinion in Plant Biology, 66: 102190, DOI: 10.1016/j.pbi.2022.102190 Clave: R

133) Martí M., F. Merwaiss, A. Butkovic and J.A. Daròs (2022)
Production of potyvirus-derived nanoparticles decorated with a nanobody in biofactory plants
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 10: 877363, DOI: 10.3389/fbioe.2022.877363
Clave: A

132) Calvache C., M. Vazquez-Vilar, S. Selma, M. Uranga, A. Fernández-del-Carmen, J.A. Daròs and D. Orzáez (2022)
Strong and tunable anti-CRISPR/Cas activities in plants
Plant Biotechnology Journal, 20 (2): 399-408, DOI: 10.1111/pbi.13723 Clave: A

131) López-Dolz L, M. Spada, J.A. Daròs and A. Carbonell (2022)
Fine-tuning plant gene expression with synthetic trans-acting small interfering RNAs
Methods in Molecular Biology (Plant Gene Silencing), 2408: 227-242, DOI: 10.1007/978-1-0716-1875-2_15 Clave: R

130) Ortolá B. and J.A. Daròs (2022)
Production of recombinant RNA in Escherichia coli using eggplant latent viroid as a scaffold
Methods in Molecular Biology (Viroids: Methods and Protocols), 2316: 315-327, DOI: 10.1007/978-1-0716-1464-8_25 Clave: R

129) Daròs J.A. (2022)
Two-dimensional polyacrylamide-gel electrophoresis analysis of viroid RNAs
Methods in Molecular Biology (Viroids: Methods and Protocols), 2316: 79-88, DOI: 10.1007/978-1-0716-1464-8_8 Clave: R

128) Ortolá B., T. Cordero, X. Hu and J.A. Daròs (2021)
Intron-assisted, viroid-based production of insecticidal circular double-stranded RNA in Escherichia coli
RNA Biology, 18 (11): 1846-1857, DOI: 10.1080/15476286.2021.1872962 Clave: A

127) Uranga M., M. Vazquez-Vilar, D. Orzáez and J.A. Daròs (2021)
CRISPR-Cas12a genome editing at the whole-plant level using two compatible RNA virus vectors
CRISPR Journal, 4 (5): 761-769, DOI: 10.1089/crispr.2021.0049 Clave: A

126) Ambrós S., N. Gómez-Muñoz, S. Giménez-Santamarina, J. Sánchez-Vicente, J. Navarro-López, F. Martínez, J.A. Daròs and G. Rodrigo (2021)
Molecular signatures of silencing suppression degeneracy from a complex RNA virus
PLoS Computational Biology, 17 (6): e1009166, DOI: 10.1111/pbi.13723 Clave: A

125) Montagud-Martínez R., M. Heras-Hernández, L. Goiriz, J.A. Daròs and G. Rodrigo (2021)
CRISPR-mediated strand displacement logic circuits with toehold-free DNA
ACS Synthetic Biology, 10 (5): 950-956, DOI: 10.1021/acssynbio.0c00649 Clave: A

124) Uranga M., V. Aragonés, S. Selma, M. Vázquez-Vilar, D. Orzáez and J.A. Daròs (2021)
Efficient Cas9 multiplex editing using unspaced sgRNA arrays engineering in a Potato virus X vector
Plant Journal, 106 (2): 555-565, DOI: 10.1111/tpj.15164 Clave: A

123) Daròs J.A. (2021)
Identification and functional characterization of viroid circular RNAs
Methods in Molecular Biology (Plant Circular RNAs: Methods and Protocols), 2362:101-107, DOI: 10.1007/978-1-0716-1645-1_6 Clave: R

122) Daròs J.A. (2021)
Production of circular recombinant RNA in Escherichia coli using viroid scaffolds
Methods in Molecular Biology (RNA Scaffolds: Methods and Protocols), 2323: 99-107, DOI: 10.1007/978-1-0716-1499-0_8 Clave: R

121) Llorente B., S. Torres-Montilla, L. Morelli, I. Florez-Sarasa, J.T. Matus, M. Ezquerro, L. D’Andrea, F. Houhou, E. Majer, B. Picó, J. Cebolla, A. Troncoso, A.R. Fernie, J.A. Daròs and M. Rodriguez-Concepcion (2020).
Synthetic conversion of leaf chloroplasts into carotenoid-rich plastids reveals mechanistic basis of natural chromoplast development.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA 117 (35): 21796-21803, DOI: 10.1073/pnas.2004405117 Clave: A

120) Martí M., G. Diretto, V. Aragonés, S. Frusciante, O. Ahrazem, L. Gómez-Gómez and J.A. Daròs (2020).
Efficient production of saffron crocins and picrocrocin in Nicotiana benthamiana using a virus-driven system.
Metabolic Engineering 61: 238-250, DOI: 10.1016/j.ymben.2020.06.009 Clave: A

119) Flores R., J.A. Daròs, C. Hernández, B. Navarro, F. Di Serio (2020).
Viroids.
Encyclopedia of Life Science, 1: 192-203, DOI: 10.1002/9780470015902.a0029141 Clave: R

118) López-Dolz L., M. Spada, J.A. Daròs and A. Carbonell (2020).
Fine-tune control of targeted RNAi efficacy by plant artificial small RNAs.
Nucleic Acids Research 48 (11): 6234-6250, DOI: 10.1093/nar/gkaa343 Clave: A

117) El-Abeid S.E., Y. Ahmed, J.A. Daròs and M.A. Mohamed (2020).
Reduced graphene oxide nanosheet-decorated copper oxide nanoparticles: a potent antifungal nanocomposite against Fusarium root rot and wilt diseases of tomato and pepper plants.
Nanomaterials 10 (5): 1001, DOI: 10.3390/nano10051001 Clave: A

116) Nuraini L., Y. Ando, K. Kawai, F. Tatsuzawa, K. Tanaka, M. Ochiai, K. Suzuki, V. Aragonés, J.A. Daròs and T. Nakatsuka (2020).
Anthocyanin regulatory and structural genes associated with violet flower color of Matthiola incana.
Planta 251 (3): 61, DOI:10.1007/s00425-020-03351-z Clave: A

115) Daròs J.A. (2020).
Use of potyvirus vectors to produce carotenoids in plants.
Methods in Molecular Biology (Plant and Food Carotenoids) 2083: 303-312, DOI:10.1007/978-1-4939-9952-1_23 Clave: R

114) Cervera-Seco L., M.C. Marques, A. Sanz-Carbonell, J. Marquez-Molins, A. Carbonell, J.A. Daròs and G. Gomez (2019).
Identification and characterization of a stress-responsive TAS3-derived tasiRNAs in melon.
Plant and Cell Physiology, 60 (11): 2382-2393, DOI: 10.1093/pcp/pcz131 Clave: A

113) Carbonell A., P. Lisón and J.A. Daròs (2019).
Multi-targeting of viral RNAs with synthetic trans-acting small interfering RNAs enhances plant antiviral resistance.
Plant Journal, 100 (4): 720-737, DOI: 10.1111/tpj.14466 Clave: A

112) Pérez-de-Castro A., C. Esteras, A. Alfaro-Fernández, J.A. Daròs, A.J. Monforte, B. Picó and M.L. Gómez-Guillamón (2019).
Fine mapping of wmv1551, a resistance gene to Watermelon mosaic virus in melon.
Molecular Breeding, 39 (7): 93, DOI: 10.1007/s11032-019-0998-z Clave: A

111) Shi X., T. Cordero, S. Garrigues, J.F. Marcos, J.A. Daròs and M. Coca (2019).
Efficient production of antifungal proteins in plants using a new transient expression vector derived from tobacco mosaic virus.
Plant Biotechnology Journal, 17 (6): 1069-1080, DOI: 10.1111/pbi.13038 Clave: A

110) Pasin F., W. Menzel and J.A. Daròs (2019).
Harnessed viruses in the age of metagenomics and synthetic biology: an update on infectious clone assembly and biotechnologies of plant viruses.
Plant Biotechnology Journal, 17 (6): 1010-1026, DOI: doi: 10.1111/pbi.13084 Clave: R

109) Di Serio F., E.M. Torchetti, J.A. Daròs and B. Navarro (2019).
Reassessment of viroid RNA cytosine methylation status at the single nucleotide level.
Viruses, 11 (4): E357, DOI: 10.3390/v11040357 Clave: A

108) Gobatto D., L.A. de Oliveira, D.A. de Siqueira Franco, N. Velásquez, J.A. Daròs and M. Eiras (2019).
Surveys in the chrysanthemum production areas of Brazil and Colombia reveal that weeds are potential reservoirs of chrysanthemum stunt viroid.
Viruses, 11 (4): E355, DOI: 10.3390/v11040355 Clave: A

107) Aragonés V., A. Pérez-de-Castro, T. Cordero, J. Cebolla-Cornejo, C. López, B. Picó and J.A. Daròs (2019).
A Watermelon mosaic virus clone tagged with the yellow visual maker phytoene synthase facilitates scoring infectivity in melon breeding programs.
European Journal of Plant Pathology, 153: 317-323, DOI: 10.1007/s10658-018-01621-x Clave: A

106) Daròs J.A. (2019).
¿Pueden transformarse los virus de plantas en herramientas útiles para la biotecnología?
Revista Alimentaria, 501: 90-92 Clave: R

105) Carbonell A., C. López and J.A. Daròs (2019).
Fast-forward identification of highly effective artificial small RNAs against different tomato spotted wilt virus isolates.
Molecular Plant-Microbe Interactions, 32 (2): 142-156, DOI: 10.1094/MPMI-05-18-0117-TA Clave: A

104) Carbonell A. and J.A. Daròs (2019).
Design, synthesis, and functional analysis of highly specific artificial small RNAs with antiviral activity in plants.
Methods in Molecular Biology, 2028: 231-246, DOI: 10.1007/978-1-4939-9635-3_13 Clave: R

103) Cordero T., V. Aragonés and J.A. Daròs (2018).
Large-scale production of recombinant RNAs on a circular scaffold using a viroid-derived system in Escherichia coli.
Journal of Visualized Experiments, 141: e58472, DOI: 10.3791/58472 Clave: R

102) Cordero T., A. Rosado, E. Majer, A. Jaramillo, G. Rodrigo and J.A. Daròs (2018).
Boolean computation in plants using post-translational genetic control and a visual output signal.
ACS Synthetic Biology, 7 (10): 2322-2330, DOI: 10.1021/acssynbio.8b00214 Clave: A

101) Cordero T., B. Ortolá and J.A. Daròs (2018).
Mutational analysis of Eggplant latent viroid RNA circularization by the eggplant tRNA ligase in Escherichia coli.
Frontiers in Microbiology 9: 635, DOI: 10.3389/fmicb.2018.00635 Clave: A

100) Daròs J.A., V. Aragonés and T. Cordero (2018).
A viroid-derived system to produce large amounts of recombinant RNA in Escherichia coli.
Scientific Reports 8 (1): 1904, DOI: 10.1038/s41598-018-20314-3 Clave: A

99) Rodrigo G., S. Prakash, S. Shen, E. Majer, J.A. Daròs and A. Jaramillo (2017).
Model-based design of RNA hybridization networks implemented in living cells.
Nucleic Acids Research 45 (16): 9797-9808, DOI: 10.1093/nar/gkx698 Clave: A

98) Daròs J.A. (2017).
Viral suppressors: combating RNA silencing.
Nature Plants 3: 17098, DOI: 10.1038/nplants.2017.98 Clave: R

97) Carbonell A. and J.A. Daròs (2017).
Artificial microRNAs and synthetic trans-acting small interfering RNAs interfere with viroid infection.
Molecular Plant Pathology 18 (5): 746-753, DOI: 10.1111/mpp.12529 Clave: A

96) Abdel-Hafez S.I.I., N.A. Nafady, I.R. Abdel-Rahim, A.M. Shaltout, J.A. Daròs and M.A. Mohamed (2017).
Biosynthesis of silver nanoparticles using the compound curvularin isolated from the endophytic fungus Epicoccum nigrum: characterization and antifungal activity.
Journal of Pharmaceutical and Applied Chemistry 3 (2): 135-146, DOI: 10.18576/jpac/030207

95) López-González S., V. Aragonés, J.A. Daròs, F. Sánchez and F. Ponz (2017).
An infectious cDNA clone of a radish-infecting Turnip mosaic virus strain.
European Journal of Plant Pathology 148: 207-211, DOI: 10.1007/s10658-016-1057-9 Clave: A
94) Cordero T., M.A. Mohamed, J.J. López-Moya and J.A. Daròs (2017).
A recombinant Potato virus Y infectious clone tagged with the Rosea1 visual marker (PVY-Ros1) facilitates the analysis of viral infectivity and allows the production of large amounts of anthocyanins in plants.
Frontiers in Microbiology 8: 611, DOI: 10.3389/fmicb.2017.00611 Clave: A

93) Rodrigo G., J.A. Daròs and S.F. Elena (2017).
Virus-host interactome: putting the accent on how it changes.
Journal of Proteomics 156: 1-4, DOI: 10.1016/j.jprot.2016.12.007 Clave: R

92) Majer E., B. Llorente, M. Rodríguez-Concepción and J.A. Daròs (2017).
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Journal of Virology, 74 (22): 10390-10400, DOI: 10.1128/JVI.74.22.10390-10400.2000
Clave: A
16) Flores, R., J.A. Daròs and C. Hernández (2000).
Avsunviroidae family: viroids containing hammerhead ribozymes.
Advances in Virus Research, 55: 271-323, DOI: 10.1016/S0065-3527(00)55006-4 Clave: R

15) Daròs, J.A., M. Schaad and J.C. Carrington (1999).
Functional analysis of the interaction between VPg-proteinase (NIa) and RNA polymerase (NIb) of tobacco etch potyvirus, using conditional and suppressor mutants.
Journal of Virology, 73 (10): 8732-8740. Clave: A

14) Navarro, J.A., J.A. Daròs and R. Flores (1999)
Complexes containing both polarity strands of avocado sunblotch viroid: identification in chloroplasts and characterization.
Virology, 253 (1): 77-85, DOI: 10.1006/viro.1998.9497 Clave: A

13) Navarro, B., J.A. Daròs and R. Flores (1998).
Reverse transcription polymerase chain reaction protocols for cloning small circular RNAs.
Journal of Virological Methods, 73 (1): 1-9, DOI: 10.1016/S0166-0934(98)00042-1 Clave: A

12) Haldeman-Cahill, R., J.A. Daròs and J.C. Carrington (1998).
Secondary structures in the capsid protein coding sequence and 3′ nontranslated region involved in amplification of the tobacco etch virus genome.
Journal of Virology, 72 (5): 4072-4079. Clave: A

11) Daròs, J.A. and J.C. Carrington (1997).
RNA binding activity of NIa proteinase of tobacco etch potyvirus.
Virology, 237 (2): 327-336, DOI: 10.1006/viro.1997.8802 Clave: A

10) Di Serio, F., J.A. Daròs, A. Ragozzino and R. Flores (1997).
A 451-nucleotide circular RNA from cherry with hammerhead ribozymes in its strands of both polarities.
Journal of Virology, 71 (9): 6603-6610. Clave: A

9) Daròs, J.A. and R. Flores (1996).
A group I plant intron accumulates as circular RNA forms with extensive 5’ deletions in vivo.
RNA, 2 (9): 928-936. Clave: A

8) Navarro, B., J.A. Daròs and R. Flores (1996).
A general strategy for cloning viroids and other small circular RNAs that uses minimal amounts of template and does not require prior knowledge of its sequence.
Journal of Virological Methods, 56 (1): 59-66, DOI: 10.1016/0166-0934(95)01912-X Clave: A

7) Daròs, J.A. y R. Flores (1995).
Viroides y otros pequeños RNAs circulares e infecciosos de animales y plantas.
En Microbiología y Genética Molecular, Josep Casadesús (ed.) Servicio de Publicaciones de la Universidad de Huelva. ISBN: 84-88751-24-9. Clave: CL

6) Daròs, J.A. and R. Flores (1995).
Characterization of multiple circular RNAs derived from a plant viroid-like RNA by sequence deletions and duplications.
RNA, 1 (7): 734-744. Clave: A

5) Daròs, J.A. and R. Flores (1995).
Identification of a retroviroid-like element from plants.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA, 92 (15): 6856-6860, DOI: 10.1073/pnas.92.15.6856 Clave: A

4) Daròs, J.A., J.F. Marcos, C. Hernández and R. Flores (1994).
Replication of avocado sunblotch viroid: evidence for a symmetric pathway with two rolling circles and hammerhead ribozyme processing.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA, 91 (26): 12813-12817, DOI: 10.1073/pnas.91.26.12813 Clave: A

3) Hernández, C., J.A. Daròs, S.F. Elena, A. Moya and R. Flores (1992).
The strands of both polarities of a small circular RNA from carnation self-cleave in vitro through alternative double- and single-hammerhead structures.
Nucleic Acids Research, 20 (23): 6323-6329, DOI: 10.1093/nar/20.23.6323 Clave: A

2) Braco, L., J.A. Daròs and M. de la Guardia (1992).
Enzymatic flow injection analysis in nonaqueous media.
Analytical Chemistry, 64 (2): 129-133, DOI: 10.1021/ac00026a006 Clave: A

1) Rández-Gil, F., J.A. Daròs, A. Salvador and M. de la Guardia (1991).
Direct derivative spectrophotometric determination of nitrazepam and clonazepam in biological fluids.
Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 9 (7): 539-545, DOI: 10.1016/0731-7085(91)80175-9 Clave: A

10) Talens-Perales D., J.A. Daròs, J. Polaina, J. Marín-Navarro
Combination of endolysin and glucose oxidase and uses thereof
Número de solicitud: EP24383069
Fecha de solicitud: 3 Octubre 2024
Entidad titular: CSIC, Universitat de València y Universitat Politècnica de València.

9) Orzáez D., M. Vazquez-Vilar, A. Fernández, C. Maestre, C. de Paola, J.A. Daròs, E. García
A Nicotiana tabacum plant with mutations in FT and SPL gnes and its use as biofactory
Número de solicitud: EP23382830
Fecha de solicitud: 8 Agosto 2023
Entidad titular: CSIC y Universitat Politècnica de València.

8) Carbonell A.T., J.A. Daròs, A.E. Cisneros
Minimal precursors of syn-tasiRNAs
Número de solicitud: EP23382795
Fecha de solicitud: 28 Julio 2023
Entidad titular: CSIC y Universitat Politècnica de València.

7) Carbonell A.T., J.A. Daròs, A.E. Cisneros, Martín-García T.
Minimal miRNA precursors
Número de solicitud: EP23382794
Fecha de solicitud: 28 Julio 2023
Entidad titular: CSIC y Universitat Politècnica de València.

6) Darós J.A., B. Ortolá and M.T. Cordero.
Method for the production of double-stranded RNA.
Número de solicitud: EP19382997.5, PCT/EP2020/082018
Fecha de solicitud: 13 November 2020.
Entidad titular: CSIC y Universitat Politècnica de València.
Licenciada: Arana Biosciences (Cambridge, MA, USA) desde 26-03-2021 (opción de licencia 11-11-2020).

5) Carbonell A. and J.A. Darós.
Method for modulating the gene silencing degree induced by trans-acting small interfering RNAs.
Número de solicitud: EP19382445.5.
Fecha de solicitud: 31 mayo 2019.
Entidad titular: CSIC y Universitat Politècnica de València.

4) Darós J.A., V. Aragonés and M.T. Cordero.
Recombinant RNA production.
Número de solicitud: EP14382177.5, PCT/EP2015/060912.
Fecha de solicitud: 18 mayo 2015.
Entidad titular: CSIC y Universitat Politècnica de València.
Licenciada: Plant Bioscience Limited (Norwich, Reino Unido) desde 30-07-2013 a 31-12-2018.

3) Darós J.A., L. Bedoya y F. Martínez.
Vector para la coexpresión de varias proteínas heterólogas en cantidades equimolares.
Número de solicitud: P201030342.
País de prioridad: España.
Fecha de solicitud: 9 marzo 2010.
Entidad titular: CSIC y Universitat Politècnica de València.
Referencia: ES 1641.687.
Extensión internacional: PCT/ES11/070150.

2) De la Guardia, M.A., A.E. Morales y J.A. Darós.
Reactor para el empleo de enzimas inmovilizadas en reacción de flujo continuo (FIA) en medios orgánicos no acuosos.
Número de solicitud: 9002666.
País de prioridad: España.
Fecha de anuncio de la concesión: 16-07-1993.
Entidad titular: Universidad de Valencia.
Número de publicación: ES 2 038 563.

1) De la Guardia, M.A., J.V. de Julián, J.A. Darós y S. Garrigues.
Separador circular de fases para diálisis y extracción líquido-líquido en línea.
Número de solicitud: 9002646.
País de prioridad: España.
Fecha de anuncio de la concesión: 16-04-1992.
Entidad titular: Universidad de Valencia.
Número de publicación: ES 2 026 358.

17) Nicolau Sanus, María (Doctorado en Biotecnología)
Universitat Politècnica de València, 30 de octubre de 2023. Calificación “Sobresaliente”, mención doctorado internacional
Production of recombinant proteins with pharmaceutical and industrial applications in plants using a tobacco mosaic virus-eerived vector
Director: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València)

16) Ortolá Navarro, Beltrán (Doctorado en Biotecnología)
Universitat Politècnica de València, 17 de febrero de 2023. Calificación “Sobresaliente Cum laude”, opta a premio extraordinario
Heterologous expression of circular RNAs in Escherichia coli for analyzing the ligation process of chloroplastic viroids and producing double-stranded RNAs with insecticidal activity
Director: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València)

15) Martí Botella, María del Carmen (Doctorado en Biotecnología)
Universitat Politècnica de València, 29 de julio de 2022. Calificación “Sobresaliente Cum laude”, mención doctorado internacional
Plant-based production of metabolites and nanoparticles using potyvirus vectors
Director: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València)

14) Uranga Ruiz de Eguino, Mireia (Doctorado en Biotecnología)
Universitat Politècnica de València, 13 de mayo de 2022. Calificación “Sobresaliente Cum laude”, mención doctorado internacional y opta a premio extraordinario
Engineering viral vectors for CRISPR-Cas mediated genome editing in plants
Director: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València).

13) Houhou, Fakhreddine (Doctorado en Biotecnología)
Universitat Politècnica de València, 29 de octubre de 2021. Calificación “Sobresaliente Cum laude”
Biotechnological application of potyvirus-based vectors in cucurbits plants
Director: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València).

12) Cordero Cucart, María Teresa (Doctorado en Biotecnología)
Universitat Politècnica de València, 18 de junio de 2021. Calificación “Sobresaliente Cum laude”
Aplicaciones del factor de transcripción Rosea1 de la ruta de las antocianinas como marcdor visual en virología molecular y biotecnología de plantas.
Director: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València).

11) Gobatto, Danielle (Doutora em Sanidade, Segurança Alimentar e Ambiental no Agronegócio).
Instituto Biológico, São Paulo, Brasil, 14 de agosto de 2018.
Chrysanthemum stunt viroid: diversidade genética, hospedeiras alternativas, interações viroide-hospedeiro e estudo do impacto na produção do crisãntemo.
Director: Prof. Dr. Marcelo Eiras (Instituto Biológico, São Paulo, Brasil); codirector: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València).

10) Majer, Eszter (Doctora en Biotecnología)
Universitat Politècnica de València, 14 de julio de 2016. Calificación “Sobresaliente Cum laude”
Metabolic engineering of plants using a disarmed potyvirus vector.
Director: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València).

9) Martínez García, Fernando
Universitat Politècnica de València, 24 de enero de 2014. Calificación “Sobresaliente Cum laude”
Análisis de la dinámica de replicación de un virus de RNA de plantas y del uso de microRNAs artificiales como estrategia antiviral.
Directores: Dr. José Antonio Darós Arnau y Prof. Santiago Francisco Elena Fito (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València).

8) Lafforgue, Guillaume Charles.
Universidad de Valencia, 5 de diciembre de 2013. Calificación “Sobresaliente Cum laude”
Resistance to virus infection mediated by artificial microRNAs: estimating the likelihood of escape mutants.
Directores: Dr. Santiago Francisco Elena Fito (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València) y Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València).

7) Bedoya Rojas, Leonor Cecilia.
Universitat Politècnica de València, 28 de noviembre de 2011. Calificación “Sobresaliente Cum laude”
Desarrollo de un vector para la expresión simultánea de múltiples proteínas en plantas basado en el potyvirus del grabado del tabaco.
Director: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València).

6) Nohales Zafra, María Ángeles.
Universitat Politècnica de València, 26 de septiembre de 2011. Calificación “Sobresaliente Cum laude”
Caracterización de actividades RNA ligasa implicadas en la replicación de los viroides nucleares y cloroplásticos.
Directores: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València) y Dr. Ricardo Flores Pedauyé (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València).

5) Marqués Signes, Jorge.
Universidad de Valencia, 10 de enero de 2011. Calificación “Sobresaliente Cum laude”
Anàlisi molecular de la malastía de les fulles trencadisses de la palmera de dàtils: RNA, proteïnes i bacteries de la rizosfera.
Directores: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València) y Dra. Nuria Durán-Vila (Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias, Moncada).

4) Torres Barceló, Clara.
Universidad de Valencia, 22 de septiembre de 2009.
Evolució molecular de la proteïna HC-Pro del TEV, supressor del silenciament de l’RNA.
Directores: Dr. Santiago Francisco Elena Fito (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València) y Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València).

3) Molina Serrano, Diego.
Universidad de Valencia, 22 de diciembre de 2008. Calificación “Apto Cum laude”
RNA ligasas nucleares y cloroplásticas: posible papel en la replicación de los viroides.
Directores: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València) y Dr. Ricardo Flores Pedauyé (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València).

2) Gas López, María Eugenia.
Universidad de Valencia, 4 de diciembre de 2007.
Replicación de los viroides nucleares: motivos estructurales y enzimas implicados en el procesamiento in vivo de sus intermediarios oligoméricos.
Directores: Dr. Ricardo Flores Pedauyé (IBMCP, CSIC- Universitat Politècnica de València), Cármen Hernández Fort (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València) y Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València).

1) Fadda, Ziad Ghaleb Nimer.
Universitat Politècnica de València, 15 de octubre de 2001. Calificación: “Sobresaliente Cum Laude”
Identificación y caracterización de pequeños RNAs en palmera datilera y berenjena.
Directores: Dra. Nuria Durán-Vila (Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias, Moncada), Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València) y Dr. Ricardo Flores Pedauyé (IBMCP, CSIC-Universitat Politècnica de València).