Metabolómica

Descripción

El Servicio de Metabolómica emplea técnicas de cromatografía acoplada a espectrometría de masas para realizar análisis metabolómicos de muestras vegetales. Todas las prestaciones incluyen la extracción y el análisis de las muestras.

COMPUESTOS VOLÁTILES

Análisis dirigido y no dirigido de compuestos volátiles. Amplia experiencia en diferentes tejidos y especies vegetales. La técnica de elección es la microextracción en fase sólida acoplada a cromatografía de gases-masas (GC-MS coupled HS-SPME).

La identificación de metabolitos de interés se realiza mediante la comparación de masas experimentales exactas (el servicio cuenta con aproximadamente 400 patrones de compuestos volátiles para una identificación inequívoca) y teóricas utilizando la base de datos NIST2017.

METABOLISMO PRIMARIO

Perfil del metabolismo primario (azúcares, aminoácidos y ácidos orgánicos) mediante derivatización y cromatografía de gases acoplada a espectrometría de masas. La prestación incluye la extracción, derivatización y análisis: identificación y cuantificación relativa de los metabolitos disponibles en la base de datos del Servicio (80 patrones. Solicitar listado al servicio)

CLOROFILAS, CAROTENOIDES Y TOCOFEROLES

Análisis conjunto de clorofilas, carotenoides y tocoferoles mediante HPLC acoplada a fotoarray de diodos (PDA) y fluorescencia.

METABOLISMO SECUNDARIO

Análisis de metabolismo secundario mediante UPLC acoplada a espectrometría de masas. Análisis dirigido y no dirigido. Base de datos interna (150 patrones) y acceso a bases de datos de MS y MS/MS.

ANÁLISIS DIRIGIDO

El servicio realiza cuantificación absoluta de metabolitos de interés para la comunidad científica y empresas del sector agronómico: vitaminas (C, E, B3, B5), poliaminas, crocinas, nucleósidos. Para puesta a punto de nuevos métodos y compuestos de interés, contactar con el Servicio.

ANÁLISIS DE ETILENO

Análisis de etileno de tejido verde y frutos, medidas de acumulación y de emisión en tiempo real.

Normas, solicitudes, tarifas

REGLAS GENERALES

Pasos a seguir para solicitar una analítica al Servicio de Metabolómica:

Usuarios internos

1. Solicitar el servicio a través de Gestcompras

2. Rellenar el cuestionario disponible en esta misma página indicando:

– Breve resumen del diseño experimental
– Tipo de análisis solicitado
– Nombre de las muestras y peso exacto

y enviar a: aespino@ibmcp.upv.es

2. Una vez aceptada la solicitud, entregar las muestras al Servicio.

3. Las muestras se procesarán según pedido en Gestcompras.

Usuarios externos

1. Rellenar el cuestionario disponible en esta misma página indicando:

– Breve resumen del diseño experimental
– Tipo de análisis solicitado
– Nombre de las muestras y peso exacto

y enviar a: aespino@ibmcp.upv.es

2. Los usuarios externos recibirán un formulario de pedido (Hoja de encargo), que deberán devolver firmado y sellado. Las muestras se procesarán una vez recibida la hoja de encargo.

3. Al finalizar el trabajo, recibirán una nota de entrega, que también deberá ser devuelto firmado y sellado.

4. A continuación, se emitirá la factura.

El material a analizar debe entregarse triturado y congelado en hielo seco o nitrógeno líquido. Consultar previamente la cantidad de muestra necesaria en función del tipo de análisis.

Cuestionario Metabolómica IBMCP

TARIFAS 2023 SERVICIO DE METABOLOMICA IBMCP

Equipamiento

1.Cromatógrafo de gases acoplado a espectrómetro de masas (cuadrupolo):

  • GC: Agilent 6890N
  • MS: Agilent Q5975B inerte XL MSD
  • Equipado con muestreador automático Combi PAL CTC Analytics

2. Cromatógrafo de gases acoplado a espectrómetro de masas (ToF):

  • GC: Agilent 6890N
  • MS: LECO Pegasus 4D TOF
  • Equipado con muestreador automático Combi PAL CTC Analytics

3. UPLC con detector de matriz de fotodiodos (PDA), Acquity (Waters)

4. HPLC con detector de fluorescencia y matriz de fotodiodos (PDA) (Waters 2965)

5. Equipo de detección y cuantificación de etileno de alta sensibilidad (0,3 ppbs) equipado con:

  • Catalizador para la eliminación de hidrocarburos del aire
  • Detector de alta sensibilidad (ETD300, Sensor Sense)

Cofinanciado con Fondos FEDER

6. UHPLC acoplado a espectrómetro de masas (Orbitrap)

  • UHPLC: Thermo Scientific Vanquish
  • MS: Thermo Scientific Exploris 120

Convocatoria AEI, cofinanciada con Fondos FEDER

7. Equipo de detección de óxidos de nitrógeno de alta sensibilidad (50 ppts) T200U (Teledyne)

Cofinanciado con Fondos FEDER

8.Equipo de detección de CO2 y H2O de alta sensibilidad (0 a 20.000 ppms) LI-850 (LI-COR)

Cofinanciado con Fondos FEDER

Personal

Antonio Granell

Responsable Científico

Ana Espinosa Ruiz

Responsable técnico

Teresa Caballero Vizcaíno

Técnico de laboratorio

María Ángeles Martínez-Godoy

Técnico de laboratorio

Contacto

aespino@ibmcp.upv.es

Tel.: +34 96 387 77 72

Horario