Genómica

Descripción

El servicio ofrece el análisis de muestras mediante electroforesis por nanocapilares (Bioanalyzer 2100 de Agilent). El análisis permite conocer la integridad de muestras de ácidos nucléicos (ARN y ADN) como requisito previo de calidad a su utilización en otros experimentos, realizar genotipados de ADN y seguimientos de los procesos de purificación de proteínas de manera precisa.

Ofrece asesoramiento para la cuantificación de biomoléculas mediante el Fluorímetro Qubit 4 de Invitrogen.  Así como la utilización del sonicador de cromatina Bioruptor Pico de Diagenode.

El servicio de genómica también se encarga del mantenimiento del Biorepositorio del IBMCP. Cuyas normas de funcionamiento se presentan en el siguiento documento.   IBMCP biorepository guide

Por último, el IBMCP ha puesto a punto un nuevo servicio de producción de proteína recombinantes en E. coli. El servicio parte del organismo transformado con la proteína recombinante etiquetada con His/MBP/GST. Realizará ensayos de expresión a pequeña escala para diseñar el protocolo con los parámetros optimizados para la proteína específica. Más información en el siguiente PDF.flyer_externo_servppro

Normas, solicitudes, tarifas

Procedimiento administrativo

Usuarios Externos

  1. Los usuarios solicitarán presupuesto en función de diseño de su experimento.
  2. Una vez acordado la realización del experimento, facilitarán los datos de Usuario Externo que coincidirán con los datos de facturación posterior.
  3. A su vez, tramitarán Hoja de Encargo según normativa.
  4. Los usuarios entregarán las muestras para su procesado directamente al servicio por mensajería.
  5. Tras la realización del análisis se recogerán o enviarán los archivos de datos generados.
  6. Los usuarios entregarán la Nota de Entrega que deberá tramitarse de conformidad a la normativa.

Usuarios Internos

  1. Los usuarios solicitarán presupuesto, en caso necesario.
  2. Se tramitará el Pedido Interno a través de la plataforma GestCompras del centro.
  3. Se acordará con el usuario, la recogida de muestra y el envío de los resultados tras el análisis.

Requisitos/Tarifas muestras RNA para su análisis de calidad con Bioanalyzer 2100

Kit Nano RNA6000 :  5 ul por muestra con concentración comprendida entre 50-500 ng/ul. En tubos individuales de 0.2ml.

Usuarios internos:  36€/chip 12 muestras.

Usuarios externos: 60€/chip 12 muestras.

Para muestras de DNA y proteínas consultar requisitos/tarifas con el servicio.

El Bioruptor Pico lo manejará directamente el usuario, debiendo indicar fecha/hora y ciclos de uso.

Para el fluorímetro Qubit 4 el laboratorio usuario deberá adquirir los kits necesarios e indicar el día de utilización.

Equipamiento

Fluorímetro Qubit 4 de Invitrogen

IBMCP Genómica2

Bioanalizador 2100 de Agilent Technologies.

Sistema de Fragmentación Bioruptor Pico de Diagenode

Personal

Lorena Latorre Garcia

Responsable del Servicio

Contacto

lolagar@ibmcp.upv.es

Tel.: +34 96 387 78 85
Ext.: 77885

Horario