Marcos de la Peña del Rivero
Email: rivero@ibmcp.upv.es
Teléfono: '+34 963 877 915
Puesto: Investigador en Plantilla / Científico Titular CSIC
Grupo: Genómica Funcional y Biotecnología de RNAs No Codificantes
ORCID: 0000-0002-7949-8459
Biografía
Actualmente soy Científico Titular del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC). Mis intereses de investigación se centran en las capacidades del ARN tanto como molécula genómica (genomas de virus ARN/viroides y retroelementos) como catalítica (ribozimas). Mi grupo ha demostrado previamente que las ribozimas pequeñas están conservadas desde bacterias hasta genomas humanos, cambiando la visión sobre las capacidades catalíticas de la mayoría de los transcriptomas. Siguiendo enfoques bioinformáticos y experimentales, hemos desentrañado los roles biológicos de algunas de estas ribozimas en nuevas formas de retrotransposición del ADN a través de pequeños ARN circulares. Más recientemente, hemos caracterizado nuevas ribozimas en virus tipo Delta de animales, cuyos resultados, en combinación con la plataforma Serratus, nos han permitido descubrir miles de nuevos agentes infecciosos de ARN circular con ribozimas como parte de un nuevo reino viral denominado Ribozyviria.
Publicaciones destacadas
- Edgar R, Taylor J, Lin V, Altman T, Barbera P, Meleshko D, Lohr D, Novakovsky G, Buchfink B, Al-Shayeb B, Banfield JF, de la Peña M., Korobeynikov A, Chikhi R, Babaian A (2022) Petabase-scale sequence alignment catalyses viral discovery. Nature 602:142-147 (all authors contributed equally) doi: 10.1038/s41586-021-04332-2
- de la Peña, M. (2021) Small Self‐Cleaving Ribozymes in the Genomes of Vertebrates. Ribozymes Vol 2, Editorial Wiley-VCH GmbH (Chapter 11, Editors: S. Müller, B. Masquida y W. Winkler) doi: 10.1002/9783527814527.ch11
- de la Peña, M. , Ceprián, R., Casey, J.L., Cervera, A. (2021) Hepatitis delta virus-like circular RNAs from diverse metazoans encode conserved hammerhead ribozymes. Virus Evol 7(1): veab016
- de la Peña, M. , Ceprián, R., Cervera, A. (2020) A singular and widespread group of mobile genetic elements: RNA circles with autocatalytic ribozymes. Cells, 9(12): 2555
- Cervera, A., de la Peña, M. (2020) Small circRNAs with self-cleaving ribozymes are highly expressed in diverse metazoan transcriptomes. Nucl Acids Res, 48(9):5054-64
- de la Peña M. (2018) Circular RNAs Biogenesis in Eukaryotes Through Self-Cleaving Hammerhead Ribozymes. Adv Exp Med Biol. 1087:53-63. doi: 10.1007/978-981-13-1426-1_5
- Rico P., Rodrigo-Navarro A., de la Peña M., Moulisova V., Costell M., Salmerón-Sánchez M. (2018) Simultaneous Boron Ion-Channel/Growth Factor Receptor Activation for Enhanced Vascularization. Adv Biosys.1800220. doi: 10.1002/adbi.201800220
- Alquézar B, Rodríguez A, de la Peña M., Peña L (2017) Genomic Analysis of Terpene Synthase Family and Functional Characterization of Seven Sesquiterpene Synthases from Citrus sinensis. Front Plant Sci. 8:1481. doi: 10.3389/fpls.2017.01481
- de la Peña M., Cervera A (2017) Circular RNAs with hammerhead ribozymes encoded in eukaryotic genomes: The enemy at home. RNA Biol. 14(8):985-991. doi: 10.1080/15476286.2017.1321730.
- de la Peña M., García-Robles I, Cervera A (2017) The Hammerhead Ribozyme: A Long History for a Short RNA. Molecules. 22(1). pii: E78. doi: 10.3390/molecules22010078.
- Cervera A, Urbina D, de la Peña M. (2016) Retrozymes are a unique family of non-autonomous retrotransposons with hammerhead ribozymes that propagate in plants through circular RNAs. Genome Biol. 17(1):135. doi: 10.1186/s13059-016-1002-4.
- Cervera A, de la Peña M. (2014) Eukaryotic penelope-like retroelements encode hammerhead ribozyme motifs. Mol Biol Evol. 31(11):2941-7. doi: 10.1093/molbev/msu232.
- Kyrieleis OJ, Chang J, de la Peña M., Shuman S, Cusack S (2014) Crystal structure of vaccinia virus mRNA capping enzyme provides insights into the mechanism and evolution of the capping apparatus. Structure. 2014 Mar 4;22(3):452-65. doi: 10.1016/j.str.2013.12.014.
- García-Robles I, Sánchez-Navarro J, de la Peña M. (2012) Intronic hammerhead ribozymes in mRNA biogenesis. Biol Chem. 393(11):1317-26. doi: 10.1515/hsz-2012-0223.
- Hammann C, Luptak A, Perreault J, de la Peña M. (2012) The ubiquitous hammerhead ribozyme. RNA. 18(5):871-85. doi: 10.1261/rna.031401.111.
- Kalweit A, Przybilski R, Seehafer C, de la Peña M., Hammann C (2012) Characterization of hammerhead ribozyme reactionsMethods Mol Biol. 848:5-20. doi: 10.1007/978-1-61779-545-9_2.de la Peña M., García-Robles I (2010) Ubiquitous presence of the hammerhead ribozyme motif along the tree of lifeRNA. 16(10):1943-50. doi: 10.1261/rna.2130310.
- de la Peña M., García-Robles I (2010) Intronic hammerhead ribozymes are ultraconserved in the human genomeEMBO Rep. 11(9):711-6. doi: 10.1038/embor.2010.100.
- de la Peña M., Dufour D, Gallego J (2009) Three-way RNA junctions with remote tertiary contacts: a recurrent and highly versatile foldRNA. 15(11):1949-64. doi: 10.1261/rna.1889509.
- Wulff BB, Heese A, Tomlinson-Buhot L, Jones DA, de la Peña M., Jones JD (2009) The major specificity-determining amino acids of the tomato Cf-9 disease resistance protein are at hypervariable solvent-exposed positions in the central leucine-rich repeatsMol Plant Microbe Interact. 22(10):1203-13. doi: 10.1094/MPMI-22-10-1203.