Portada » Grupos de Investigación » Plant Virus Biotechnology
Linkedin Twitter Youtube
Login
  • Español
Menu
  • Español
IBMCP logo 10
  • About Us
    • About Us
    • Management & Organisation
    • Facts & Figures
    • Inclusive Science
  • Staff
    • Staff Researchers
    • Career Track Fellows
    • Postdoctoral Researchers
    • Predoctoral Researchers
    • Management
    • Services
    • Former Members
  • Research
    • Research Departments
    • Research Groups
    • Publications
  • Services
    • DNA Sequencing And Gene Expression Analysis
    • Metabolomics
    • Microscopy
    • Plant Hormone Quantification
    • Proteomics
    • Genomics
    • Bioinformatics
  • Newsroom
    • Latest News
    • Outreach
    • Press Room
    • Media Resources
  • Education
    • Master’s Degree
    • All BDT/MDT Offers
  • Seminars And Events
    • Seminars
    • Events
  • Join Us
    • HR Strategy
    • Active Job Offers
Menu
  • About Us
    • About Us
    • Management & Organisation
    • Facts & Figures
    • Inclusive Science
  • Staff
    • Staff Researchers
    • Career Track Fellows
    • Postdoctoral Researchers
    • Predoctoral Researchers
    • Management
    • Services
    • Former Members
  • Research
    • Research Departments
    • Research Groups
    • Publications
  • Services
    • DNA Sequencing And Gene Expression Analysis
    • Metabolomics
    • Microscopy
    • Plant Hormone Quantification
    • Proteomics
    • Genomics
    • Bioinformatics
  • Newsroom
    • Latest News
    • Outreach
    • Press Room
    • Media Resources
  • Education
    • Master’s Degree
    • All BDT/MDT Offers
  • Seminars And Events
    • Seminars
    • Events
  • Join Us
    • HR Strategy
    • Active Job Offers
Discovering

GROUP: Plant Virus Biotechnology

  • Research Line : Biotechnology And Plant Breeding Of Cultivated Species, Molecular And Evolutionary Plant Virology
Research
Staff
Publications
Other publications
Projects
Patents
Thesis
Gallery
Research

Las plantas son huéspedes de una gran variedad de agentes infecciosos, los cuales frecuentemente causan un enorme daño en los cultivos y los ecosistemas naturales. El primer objetivo de nuestro grupo de investigación es entender los mecanismos moleculares que subyacen a la interacción entre las plantas y algunos de estos patógenos como son los virus y los viroides.

A partir de este conocimiento esperamos desarrollar nuevas estrategias biotecnológicas para la protección e innovación en los cultivos. Además, creemos que las extraordinarias propiedades biológicas de los virus y viroides se pueden aprovechar convirtiéndolos en útiles instrumentos biotecnológicos. Nuestro segundo objetivo es desarrollar sistemas para producir productos de interés (metabolitos, RNAs, proteínas, anticuerpos…) en plantas biofactoría utilizando virus y viroides convenientemente manipulados.

Nosotros imaginamos un futuro en el que las plantas cultivadas serán la fuente más fiable y sostenible de alimento, forraje, fibras, combustible y productos químicos y farmacéuticos para la humanidad.

Líneas de investigación:

Más concretamente, algunas de las investigaciones que actualmente están en marcha en nuestro grupo tienen como objetivo:

1. Descifrar como los RNAs viroidales son capaces de replicarse en las células de las plantas. Ver Cordero et al. 2018, Front. Microbiol.

2. Entender la respuesta defensiva de las plantas a la infección viral. Ver Cordero et al. 2017, Mol. Plant Microbe Interact.

3. Identificar genes de resistencia a la infección viral. Ver Aragonés et al. 2018, Eur. J. Plant Pathol.

4. Desarrollar estrategias biotecnológicas para proteger a las plantas de los virus y viroides. Ver Carbonell et al. 2017, Mol. Plant Pathol.; or Carbonell et al. 2018, Mol. Plant Microbe Interact.

5. Producir carotenoides y antocianinas saludables en plantas utilizando vectores virales. Ver Majer et al. 2017, Sci. Rep.; or Cordero et al. 2017, Front. Microbiol.

6. Producir grandes cantidades de RNAs recombinantes utilizando un sistema derivado de un viroide. Ver Daròs et al., Sci. Rep.

7. Desarrollar vectores virales para producir proteínas recombinantes en plantas. Ver Majer et al. 2015, Biotechnol. J.; or Shi et al. 2018, Plant Biotech. J.

8. Construir circuitos genéticos sintéticos para regular la expresión génica en plantas. Ver Cordero et al. 2018, ACS Synth. Biol.

Staff

Staff Researchers


Hired Personnel and Interns

Publications
  • Aragonés V., A. Pérez-de-Castro, T. Cordero, J. Cebolla-Cornejo, C. López, B. Picó and J.A. Daròs (2019)
    A Watermelon mosaic virus clone tagged with the yellow visual maker phytoene synthase facilitates scoring infectivity in melon breeding programs.

    European Journal of Plant Pathology, 153: 317-323


  • Carbonell, A (2019)
    Design and high-throughput generation of artificial small RNA constructs for plants. In: Plant MicroRNAs: Methods and Protocols

    Methods in Molecular Biology 1932: 247-260


  • Carbonell A. and J.A. Daròs (2019)
    Design, synthesis, and functional analysis of highly specific artificial small RNAs with antiviral activity in plants

    Methods in Molecular Biology, 2028: 231-246


  • Carbonell, A. and Daròs, J.A (2019)
    Design, Synthesis, and Functional Analysis of Highly Specific Artificial Small RNAs With Antiviral Activity in Plants. In: Antiviral Resistance in Plants: Methods and Protocols

    Methods in Molecular Biology 2028: 231-246


  • Shi X., T. Cordero, S. Garrigues, J.F. Marcos, J.A. Daròs and M. Coca (2019)
    Efficient production of antifungal proteins in plants using a new transient expression vector derived from tobacco mosaic virus

    Plant Biotechnology Journal, 17 (6): 1069-1080


  • Carbonell A., C. López and J.A. Daròs (2019)
    Fast-forward identification of highly effective artificial small RNAs against different tomato spotted wilt virus isolates

    Molecular Plant-Microbe Interactions, 32 (2): 142-156


  • Carbonell, A., López, C. and Daròs, J.A (2019)
    Fast-forward identification of highly effective artificial small RNAs against different Tomato spotted wilt virus isolates

    Molecular Plant-Microbe Interactions 32 (2): 142-156


  • Pérez-de-Castro A., C. Esteras, A. Alfaro-Fernández, J.A. Daròs, A.J. Monforte, B. Picó and M.L. Gómez-Guillamón (2019)
    Fine mapping of wmv1551, a resistance gene to Watermelon mosaic virus in melon.

    Molecular Breeding, 39 (7): 93


  • Pasin F., W. Menzel and J.A. Daròs (2019)
    Harnessed viruses in the age of metagenomics and synthetic biology: an update on infectious clone assembly and biotechnologies of plant viruses

    Plant Biotechnology Journal, 17 (6): 1010-1026


  • Luis Cervera-Seco, María Carmen Marqués, Alejandro Sanz-Carbonell, Joan Márquez-Molins, Alberto Carbonell, José-Antonio Daròs and Gustavo Gómez (2019)
Identification and characterization of a stress-responsive TAS3-derived tasiRNA in melon

Plant and Cell Physiology 60 (11): 2382-2393


  • Cervera-Seco L., M.C. Marques, A. Sanz-Carbonell, J. Marquez-Molins, A. Carbonell, J.A. Daròs and G. Gomez (2019)
    Identification and characterization of a stress-responsive TAS3-derived tasiRNAs in melon

    Plant & Cell Physiology, 60 (11): 2382-2393


  • Carbonell, A., Purificación Lisón and Daròs, J.A (2019)
    Multi-targeting of viral RNAs with synthetic trans-acting small interfering RNAs enhances plant antiviral resistance

    The Plant Journal 100: 720-737


  • Carbonell A., P. Lisón and J.A. Daròs (2019)
    Multi-targeting of viral RNAs with synthetic trans-acting small interfering RNAs enhances plant antiviral resistance

    Plant Journal, 100 (4): 720-737


  • Di Serio F., E.M. Torchetti, J.A. Daròs and B. Navarro (2019)
    Reassessment of viroid RNA cytosine methylation status at the single nucleotide level.

    Viruses, 11 (4): E357


  • Carbonell, A (2019)
    Secondary small interfering RNA-based silencing tools in plants: an update

    Frontiers in Plant Science 10: 687


  • Gobatto D., L.A. de Oliveira, D.A. de Siqueira Franco, N. Velásquez, J.A. Daròs and M. Eiras (2019)
    Surveys in the chrysanthemum production areas of Brazil and Colombia reveal that weeds are potential reservoirs of chrysanthemum stunt viroid.

    Viruses, 11 (4): E355


  • Daròs J.A. (2019)
    ¿Pueden transformarse los virus de plantas en herramientas útiles para la biotecnología?

    Revista Alimentaria, 501: 90-92


  • Carbonell, A (2017)
    Immunoprecipitation and high-throughput sequencing of ARGONAUTE-bound RNAs from plants. In: Plant Argonaute Proteins: Methods and Protocols

    Methods in Molecular Biology 1640: 93-112


  • Kénesi, E., Carbonell, A., Lózsa, R., Vértessy, B. and Lakatos, L (2017)
    A viral suppressor of RNA silencing inhibits ARGONAUTE 1 function by precluding target RNA binding to pre-assembled RISC

    Nucleic Acids Research 45 (13): 7736-7750


  • Carbonell, A. and Daròs, J.A (2017)
Artificial microRNAs and synthetic trans-acting small interfering RNAs interfere with viroid infection

Molecular Plant Pathology 18 (5): 746-753


  • Carbonell, A (2017)
    Artificial small RNA-based strategies for effective and specific gene silencing in plants

    Plant Gene Silencing: Mechanisms and Applications 6: 110-127.


  • Cordero, T., Cerdán, L., Carbonell, A., Katsarou, K., Kalantidis, K. and and Daròs, J.A (2017)
    Dicer-like 4 is involved in restricting the systemic movement of Zucchini yellow mosaic virus in Nicotiana benthamiana

    Molecular Plant-Microbe Interactions 30 (1): 63-71


  • Carbonell, A (2017)
    Plant Argonaute Proteins: Methods and Protocols

    Methods in Molecular Biology, vol. 1640


  • Carbonell, A (2017)
    Plant ARGONAUTEs: features, functions and unknowns. In: Plant Argonaute Proteins: Methods and Protocols

    Methods in Molecular Biology 1640: 1-21


  • Daròs JA (2016)
    Eggplant latent viroid: A friendly experimental system in the family Avsunviroidae

    Molecular Plant Pathology 12: 388


  • Carbonell, A (2016)
    El análisis de mutantes del hongo fitopatógeno Colletotrichum higginsianum deficientes en componentes clave de la maquinaria de silenciamiento génico revela la presencia inesperada de un nuevo micovirus
    Virología 19 (2): 83-84
  • Carbonell, A., Carrington, J.C.C. and Daròs, J.A (2016)
    Fast-forward generation of effective artificial small RNAs for enhanced antiviral defense in plants
    RNA and Disease 3: e 1130
  • Rodrigo G, Prakash S, Cordero T, Kushwaha M, Jaramillo A (2016)
    Functionalization of an Antisense Small RNA

    Journal of Molecular Biology 428: 889-892


  • Martinez F, Rodrigo G, Aragones V, Ruiz M, Lodewijk I, Fernandez U,i Elena SF, Daros JA (2016)
    Interaction network of tobacco etch potyvirus NIa protein with the host proteome during infection

    BMC Genomics 17: 87


  • Willemsen A, Zwart MP, Tromas N, Majer E, Daros JA, Elena SF (2016)
Multiple Barriers to the Evolution of Alternative Gene Orders in a Positive-Strand RNA Virus

Genetics 202: 1503


  • Fahlgren, N., Hill, S.T., Carrington, J.C. and Carbonell, A (2016)
    P-SAMS: a web site for plant artificial microRNA and synthetic trans-acting small interfering RNA design

    Bioinformatics 32 (1): 157-158


  • Majer E, Navarro JA, Daros JA (2015)
    A potyvirus vector efficiently targets recombinant proteins to chloroplasts mitochondria and nuclei in plant cells when expressed at the amino terminus of the polyprotein

    Biotechnology Journal 10: 1792-1802


  • Shen S, Rodrigo G, Prakash S, Majer E, Landrain TE, Kirov B, Daros JA, Jaramillo A (2015)
    Dynamic signal processing by ribozyme-mediated RNA circuits to control gene expression

    Nucleic Acids Research 43: 5158-5170


  • Carbonell, A (2015)
    Trading defense for vigour

    Nature Plants 1 (11), 15174


  • Gobatto D, Chaves ALR, Harakava R, Marque JM, Daròs JA, Eiras M (2014)
    Chrysanthemum stunt viroid in Brazil: survey, identification, biological and molecular characterization and detection methods

    Journal of Plant Pathology 96: 111-119


  • Zwart MP, Willemsen A, Daròs JA, Elena SF (2014)
    Experimental evolution of pseudogenization and gene loss in a plant RNA virus

    Molecular Biology Evolución 31: 121-134


  • Majer E, Salvador Z, Zwart MP, Willemsen A, Elena SF, Daròs JA (2014)
    Relocation of the NIb gene in the tobacco etch potyvirus genome

    Journal of Virology 88: 4586-4590


  • Martinez F, Daros JA  (2014)
    Tobacco Etch Virus Protein P1 Traffics to the Nucleolus and Associates with the Host 60S Ribosomal Subunits during Infection

    JOURNAL OF VIROLOGY 88: 10725-10737


  • Martinez F, Elena SF, Daros JA (2013)
    Fate of Artificial MicroRNA-Mediated Resistance to Plant Viruses in Mixed Infections

    Phytopathology 103: 870-876


  • Rodrigo G, Landrain TE, Majer E, Daròs JA, Jaramillo A (2013)
Full design automation of multi-state RNA devices to program gene expression using energy-based optimization

PLoS Computational Biology 9: e1003172


  • Lafforgue G, Martínez F, Niu QW, Chua NH, Daròs JA, Elena SF (2013)
    Improving the effectiveness of amiRNA-mediated resistance against Turnip mosaic virus by combining two amiRNAs or by targeting highly conserved viral genomic regions

    Journal of Virology 87: 8254-8256


  • Majer E, Daròs JA, Zwart MP (2013)
    Stability and fitness impact of the visually discernible Rosea1 marker in Tobacco etch virus genome

    Viruses 5: 2153-2168


  • Contreras-Paredes CA, Silva-Rosales L, Daros JA, Alejandri-Ramirez ND, Dinkova Tzvetanka D (2013)
    The Absence of Eukaryotic Initiation Factor eIF(iso)4E Affects the Systemic Spread of a Tobacco etch virus Isolate in Arabidopsis thaliana

    Molecular Plant-Microbe Interactions 26: 461-470


  • Molina-Serrano D, Marqués J, Nohales MA, Flores R, Darós JA (2012)
    A chloroplastic RNA ligase activity analogous to the bacterial and archaeal 2′-5′ RNA ligase

    RNA Biology 9: 326-333


  • Marqués J, Duran-Vila N, Namsi A, Bové JM, Daròs JA (2012)
    Bacteria associated with the rhizosphere of manganese-deficient date palms affected by brittle leaf disease

    Journal of Plant Pathology 94: 157-169


  • Sardanyés J, Martínez F, Daròs JA, Elena SF (2012)
    Dynamics of alternative modes of RNA replication for positive-sense RNA viruses

    Journal of the Royal Society Interface 9: 768-776


  • Zwart MP, Daròs JA, Elena SF (2012)
    Effect of Potyvirus effective population size in inoculated leaves on viral accumulation and the onset of symptoms

    Journal of Virology 86: 9737-9747


  • Carbonell, A., Flores, R. and Gago, S (2012)
    Hammerhead ribozymes against virus and viroid RNAs

    From Nucleic Acids Sequences to Molecular Medicine: 411-427


  • Nohales MA, Molina-Serrano D, Flores R , Daros JA (2012)
    Involvement of the chloroplastic isoform of tRNA ligase in the replication of the viroids belonging to the family Avsunviroidae

    Journal of Virology 86: 8269-8276


  • De la Iglesia F, Martínez F, Hillung J, Cuevas JM, Gerrish PJ, Daròs JA, Elena SF (2012)
Luria-Delbrück estimation of Turnip mosaic virus mutation rate in vivo

Journal of Virology 86: 3386-3388


  • Martínez F, Lafforgue G, Morelli MJ, González-Candelas F, Chua NH, Daròs JA, Elena SF (2012)
    Ultra-deep sequencing analysis of population dynamics of virus escape mutants in RNAi-mediated resistant plants

    Molecular Biology and Evolution 29: 3297-3307


  • Nohales MA, Flores R, Daròs JA (2012)
    Viroid RNA redirects host DNA ligase 1 to act as an RNA ligase

    Proceedings of the National Academy of Sciences USA 109: 13805-13810


  • Bedoya LC, Martínez F, Orzáez D, Daròs JA (2012)
    Visual tracking of plant virus infection and movement using a reporter MYB transcription factor that activates anthocyanin biosynthesis

    Plant Physiology 158: 1130-1138


  • Martínez F, Sardanyés J, Elena SF, Daròs JA (2011)
    Dynamics of a plant RNA virus intracellular accumulation: stamping machine versus geometric replication

    Genetics 188: 637-646


  • Zwart MP, Daròs JA, Elena, SF (2011)
    One is enough: In vivo effective population size is dose-dependent for a plant RNA virus

    PLoS Pathogens 7: e1002122


  • Eiras M, Nohales MA,Kitajima EW,Flores R,Daròs JA (2011)
    Ribosomal protein L5 and transcription factor IIIA from Arabidopsis thaliana bind in vitro specifically Potato spindle tuber viroid RNA

    Archives of Virology 156: 529-533


  • Lafforgue G, Martínez F, Sardanyés J, de la Iglesia F, Niu QW, Lin SS, Solé RV, Chua NH, Daròs JA, Elena SF (2011)
    Tempo and mode of plant RNA virus escape from RNA interference-mediated resistance

    Journal of Virology 85: 9686-9695


  • Marqués J, Duran-Vil a N, Daròs JA (2011)
    The Mn-binding proteins of the photosystem II oxygen-evolving complex are decreased in date palms affected by brittle leaf disease

    Plant Physiology and Biochemistry 49: 388-394


  • Torres-Barceló C, Daròs JA, Elena SF (2010)
    Compensatory molecular evolution of HC-Pro, an RNA-silencing suppressor from a plant RNA virus

    Molecular Biology and Evolution 27: 543-551


Torres-Barceló C, Daròs JA, Elena SF (2010)
HC-Pro hypo- and hypersuppressor mutants: differences in viral siRNA accumulation in vivo and siRNA binding activity in vitro

Archives of Virology 155: 251-254


  • Bedoya LC, Martínez F, Rubio L, Daròs JA (2010)
    Simultaneous equimolar expression of multiple proteins in plants from a dissarmed potyvirus vector

    Journal of Biotechnology 150: 268-275


  • Bedoya LC, Daròs JA (2010)
    Stability of Tobacco etch virus infectious clones in plasmid vectors

    Virus Research 149: 234-240


  • Eiras M, Silva SS, Stuchi ES, Flores R, Daros JA (2010)
    Viroid species associated with the bark-cracking phenotype of ‘Tahiti’ acid lime in the State of São Paulo, Brazil

    Tropical Plant Pathology 35: 303-309


  • Elena SF, Gómez G, Daròs JA (2009)
    Evolutionary constraints to viroid evolution

    Viruses 1: 241-254


  • Martínez F, Marqués J, Salvador ML, Daròs JA (2009)
    Mutational analysis of Eggplant latent viroid RNA processing in Chlamydomonas reinhardtii chloroplast

    Journal of General Virology 90: 3057-3065


  • Flores R, Gas ME, Molilna-Serrano D, Nohales MA, Carbonell A, Gago S, De la Peña M, Darós JA (2009)
    Viroid replication: Rolling-circles, enzymes and ribozymes

    Viruses 1: 317-334


  • Marques J, Fadda ZGN, Duran-vila N, Flores R, Bove JM, Daros JA (2008)
    A set of novel RNAs transcribed from the chloroplast genome accumulates in date palm leaflets affected by brittle leaf disease

    Phytopathology 98: 337-344


  • Flores R, Gas ME, Molina D, Hernandez C, Daros JA (2008)
    Analysis of viroid replication

    Methods in Molecular Biology 451: 167-183


  • Serra P, Barbosa CJ, Daros JA, Flores R, Duran-vila N (2008)
    Citrus viroid V: molecular characterization and synergistic interactions with other members of the genus Apscaviroid

    Virology 370: 102-112


  • Serra P, Eiras M, Bani-hashemian SM, Murcia N, Kitajima EW, Daros JA, Flores R, Duran-vila N (2008)
Citrus viroid V: occurrence, host range, diagnosis and identification of new variants

Phytopathology 98: 1199-1204


  • Torres-Barceló C, Martín S, Daròs JA, Elena SF (2008)
    From hypo- to hyper-suppression: Effect of amino acid substitutions on the RNA silencing suppressor activity of Tobacco etch virus HC-Pro

    Genetics 180: 1039-1049


  • Gas ME, Molina-Serrano D, Hernández C, Flores R, Daròs JA (2008)
    Monomeric linear RNA of Citrus exocortis viroid resulting from processing in vivo has 5′-phosphomonoester and 3′-hydroxyl termini: implications for the RNase and RNA ligase involved in replication

    Journal of Virology 82: 10321-10325


  • Flores, R., Carbonell, A., De la Peña, M., and Gago, S (2008)
    RNAs autocatalíticos: ribozimas de cabeza de martillo

    Herramientas Biotecnológicas en Fitopatología 22:407-420


  • Flores, R., Carbonell, A., Gago, S., Martínez de Alba, A.E., Delgado, S, Rodio, M.E. and Di Serio, F (2008)
    Viroid-host interactions: a molecular dialogue between two uneven partners

    Biology of Plant Microbe Interactions 6(58): 1-9


  • Carrasco P, Daròs JA, Agudelo-Romero P, Elena SF (2007)
    A real-time RT-PCR assay for quantifying the fitness of tobacco etch virus in competition experiments

    Journal of Virological Methods 139: 181-188


  • Martin R, Arenas C, Daròs JA, Covarrubias A, Reyes JL, Chua NH (2007)
    Characterization of small RNAs derived from Citrus exocortis viroid (CEVd) in infected tomato plants

    Virology 367: 135-146


  • Eiras M, Kitajima EW, Flores R, Daros JA (2007)
    Existence in vivo of the loop E motif in Potato spindle tuber viroid RNA

    Archives of Virology 152: 1389-1393


  • Sanjuán R, Daròs JA (2007)
    One-step site-directed mutagenesis of viroid dimeric cDNA

    Journal of Virological Methods 145: 71-75


  • Gas ME, Hernández C, Flores R, Daròs JA (2007)
    Processing of nuclear viroids in vivo: an interplay between RNA conformations

    PLoS Pathogens 3: 1813-1826


Molina D, Suay L, Salvador ML, Flores R, Daros JA (2007)
Processing of RNAs of the family Avsunviroidae in Chlamydomonas reinhardtii chloroplasts

Journal of Virology 81: 4363-4366


  • Hernández C, Di Serio F Ambrós S, Daròs J A, Flores R (2006)
    An element of tertiary structure in Peach latent mosaic viroid RNA revealed by UV irradiation

    Journal of Virology 80: 9336-9340


  • Di Serio F, Daros JA, Ragozzino A, Flores R (2006)
    Close structural relationship between two hammerhead viroid-like RNAs associated with cherry chlorotic rusty spot disease

    Archives of Virology 151: 1539-1549


  • Namsi A, Marqués J, Fadda Z, Takrouni ML, Ben Mahamoud O, Zouba A, Daròs JA, Flores R, Bové JM, Duran-Vila N (2006)
    Diagnosis of “maladie des feuilles cassantes” or brittle leaf disease of date palms by detection of associated chloroplast encoded double stranded RNAs

    Molecular and Cellular Probes 20: 366-370


  • Codoñer FM, Daròs JA, Solé RV, Elena SF (2006)
    The fittest versus the flattest: experimental confirmation of the quasispecies effect with subviral pathogens

    PLoS Pathogens 2: 1187-1193


  • Daros JA, Elena SF, Flores R (2006)
    Viroids: an Ariadne’s thread into the RNA labyrinth

    EMBO Reports 7: 593-598


  • Flores R, Hernández C, Martínez de Alba AE, Daròs JA, Di Serio F (2005)
    Viroids and viroid-host interactions

    Annual Reviews in Phytopathology 43: 117-139


  • Daros JA, Flores R (2004)
    Arabidopsis thaliana has the enzymatic machinery for replicating representative viroid species of the family Pospiviroidae

    Proceedings of the National Academy of Sciences USA 101: 6792-6797


  • Fadda Z, Daros JA, Fagoaga C, Flores R,Duran-vila N (2003)
    Eggplant latent viroid (ELVd): candidate type species for a new genus within family Avsunviroidae (hammerhead viroids)

    Journal of Virology 77: 6528-6532


  • Fadda Z, Daròs JA, Flores R, Durán-Vila N (2003)
    Identification in eggplant of a variant of citrus exocortis viroid (CEVd) with a 96 nucleotide duplication in the right terminal region of the rod-like secondary structure

    Virus Research 97: 145-149


Daros JA, Flores R (2002)
A chloroplast protein binds a viroid RNA in vivo and facilitates its hammerhead-mediated self-cleavage

EMBO Journal 21: 749-759


  • Flores R, Hernandez C, De La Peña M, Vera A, Daros JA (2001)
    Hammerhead ribozyme structure and function in plant RNA replication

    Methods in Enzymology 341: 540-552


  • Flores R, JA Daròs C Hernández (2000)
    Avsunviroidae family: viroids containing hammerhead ribozymes

    Advances in Virus Research 55: 271-323


  • Vera A, Daros JA, Flores R, Hernandez C (2000)
    The DNA of a plant retroviroid-like element is fused at different sites in the genome of a plant pararetrovirus and shows multiple forms with sequence deletions

    Journal of Virology 74: 10390-10400


  • Navarro JA, Daros JA, Flores R (1999)
    Complexes containing both polarity strands of avocado sunblotch viroid: identification in chloroplasts and characterization

    Virology 253: 77-85


  • Navarro B, Daros JA, Flores R (1998)
    Reverse transcription polymerase chain reaction protocols for cloning small circular RNAs

    Journal of Virological Methods 73: 1-9


  • Di Serio F, Daros JA, Ragozzino A, Flores R (1997)
    A 451-nt circular RNA from cherry with hammerhead ribozymes in its strands of both polarities

    Journal of Virology 71: 6603-6610


  • Navarro B, Daròs JA, Flores R (1996)
    A general strategy for cloning viroids and other small circular RNAs that uses minimal amounts of template and does not require prior knowledge of its sequence

    Journal of Virological Methods 56: 59-66


  • Daros JA, Flores R (1996)
    A group i plant intron accumulates as circular rna forms with extensive 5′ deletions in vivo

    RNA-A Publication of The RNA Society 2: 928-936


  • Daròs JA, R Flores (1995)
    Characterization of multiple circular RNAs derived from a plant viroid-like RNA by sequence deletions and duplications

    RNA 1: 734-744


  • Daròs JA, Flores R (1995)
    Identification of a retroviroid-like element from plants

    Proceedings of the National Academy of Sciences USA 92: 6856-6860

Other publications
Daròs, J.A. (2016)
Viroids: small noncoding infectious RNAs with the remakable ability of autonomous replication.
In Current Research Topics in Plant Virology (editores Aiming Wang and Xueping Zhou). Springer International Publishing Switzerland 2016. ISBN: 978-3-319-32917-8, ISBN: 978-3-319-32919-2 (eBook), DOI: 10.1007/978-3-319-32919-2.

Projects
Comparative systems biology of host-virus interactions (PROMETEOII/2014/021), 01-01-2014/31-12-2017.
Entidad financiadora: Generalitat Valenciana
IP: Santiago Francisco Elena Fito

Genome-wide analysis of RNA and protein interacting profiles during a plant virus infection (H2020-MSCA/0071), 01-05-2015/30-04-2017.
Entidad financiadora: Comisión Europea (Acción Marie Sklodowska-Curie)
IP: Alberto Carbonell Olivares/José Antonio Darós Arnau

Detección de patógenos y biocomputación mediante circuitos reguladores en plantas (AGL2013-49919-EXP), 01-09-2014/31-08-2016.
Entidad financiadora: MINECO
IP: José Antonio Darós Arnau

Production of recombinant RNA in Escherichia coli using a viroid scaffold (Código 050169150005), 01-04-2015/30-06-2015.
Entidad financiadora: Syngenta Crop Protection, LLC
IP: José Antonio Darós Arnau

Producción de un inóculo comercializable de la cepa avirulenta ATCC PV-593 del potyvirus del mosaico amarillo del calabacín para su uso en protección cruzada de cucurbitáceas frente a cepas virulentas de dicho virus (Ref. CSIC 13/0606 IBMCP IAB), 23-09-2013/22-02-2014.
Entidad financiadora: INVESTIGACIONES Y APLICACIONES BIOTECNOLÓGICAS S.L.
IP: José Antonio Darós Arnau

Optimización del Sistema de producción de RNA recombinante en Escherichia coli basado en el viroide latente de la berenjena (GRISOLIAP/2018/004), 1 Diciembre 2018 – 30 Septiembre 2021

Entidad financiadora: Generalitat Valenciana
IP: José Antonio Darós Arnau

Instrumentos biotecnológicos derivados de virus de plantas (BIO2014-54269-R), 01-01-2015/31-12-2017
Entidad financiadora: MINECO
IP: José Antonio Darós Arnau

Patógenos de RNA de plantas: interacción con el huésped y desarrollo de herramientas biotecnológicas (BIO2011-26741), 01-01-2012/31-12-2014.
Entidad financiadora: MICINN (MINECO)
IP: José Antonio Darós Arnau

Viroides contra insectos (BIO2017-91865-EXP),1 Noviembre 2018 – 31 Octubre 2020

Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (Gobierno de España)
IP: José Antonio Darós Arnau

Edición genómica para la introducción de resistencias a enfermedades y plagas en melón (RTC-2017-6023-2), 1 Enero 2018 – 31 Diciembre 2021

Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (Gobierno de España)
IP: José Antonio Darós Arnau

Virus de plantas: patógenos y también vectores para la producción de proteínas, metabolitos, RNAs y nanopartículas (BIO2017-83184-R), 1 Enero 2018 – 31 Diciembre 2020

Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (Gobierno de España)
IP: José Antonio Darós Arnau

Patents
Título: 
Recombinant RNA production
Fecha de solicitud: 
Martes, 20 Mayo, 2014
Autores: 
Darós, J.A., V. Aragonés and M.T. Cordero.

Título: 
Vector para la coexpresión de varias proteínas heterólogas en cantidades equimolares
Fecha de solicitud: 
Martes, 9 Marzo, 2010
Autores: 
Darós, J.A., L. Bedoya y F. Martínez.

Título: 
Reactor para el empleo de enzimas inmovilizadas en reacción de flujo continuo (FIA) en medios orgánicos no acuosos.
Fecha de solicitud: 
Viernes, 16 Julio, 1993
Autores: 
De la Guardia, M.A., A.E. Morales y J.A. Darós.

Título: 
Separador circular de fases para diálisis y extracción líquido-líquido en línea.
Fecha de solicitud: 
Jueves, 16 Abril, 1992
Autores: 
De la Guardia, M.A., J.V. de Julián, J.A. Darós y S. Garrigues

Thesis
Metabolic engineering of plants using a disarmed potyvirus vector.
Año: 2016
Nombre: Eszter Majer
Universidad: Universidad Politécnica de Valencia
Dirigida por: José Antonio Darós Arnau
Tipo: Tesis Doctorales

Análisis de la dinámica de replicación de un virus de RNA de plantas y del uso de microRNAs artificiales como estrategia antiviral
Año: 2014
Nombre: Martínez García, Fernando
Universidad: Universitat Politecnica de Valencia
Dirigida por: Dr. José Antonio Darós Arnau y Prof. Santiago Francisco Elena Fito (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia)
Tipo: Tesis Doctorales

Construcción de clones infecciosos del virus del mosaico amarillo del calabacín.
Año: 2014
Nombre: Cerdán García, Lidia
Universidad: Universidad Politécnica de Valencia
Dirigida por: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia). Tutor: Dr. Carmelo López del Rincón (COMAV, Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: Trabajos de Fin de Carrera

Resistance to virus infection mediated by artificial microRNAs: estimating the likelihood of escape mutants.
Año: 2013
Nombre: Lafforgue, Guillaume Charles G
Universidad: Universitat de València
Dirigida por: Prof. Santiago Francisco Elena Fito y Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: Tesis Doctorales

Estudio de los dominios funcionales de la proteína P1 de los potyvirus mediante mutagénesis por deleción
Año: 2013
Nombre: Torres Borja, Paula
Universidad: Universidad Politécnica de Valencia
Dirigida por: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia). Tutor: Dr. Carmelo López del Rincón (COMAV, Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: Trabajos de Fin de Carrera

Clonación y secuenciación de la RNA polimerasa cloroplástica de berenjena codificada en el núcleo para estudiar su posible implicación en la replicación del viroide latente de la berenjena
Año: 2013
Nombre: Senabre López, Irene
Universidad: Universidad de Valencia
Dirigida por: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: Trabajos de Fin de Carrera

Optimización del sistema reportero visual para el seguimiento de la infección de virus en plantas basado en el factor de transcripción Rosea1
Año: 2013
Nombre: Ortiz Sánchez, David
Universidad: Universidad Politécnica de Valencia
Dirigida por: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia). Tutor: Dr. Carmelo López del Rincón (COMAV, Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: Trabajos de Fin de Carrera

Evaluación del factor de transcripción Ant1 de tomate como marcador reportero de la infección viral en plantas
Año: 2013
Nombre: Saura Sánchez, María Teresa
Universidad: Universidad Politécnica de Valencia
Dirigida por: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia). Tutor: Dr. Carmelo López del Rincón (COMAV, Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: Trabajos de Fin de Carrera

Clonación y expresión de proteínas del virus del bronceado del tomate (TSWV) en plantas de Nicotiana benthamiana mediante un vector de expresión derivado del virus del grabado del tabaco (TEV).
Año: 2012
Nombre: Tudela Martínez, Julia María
Universidad: Universidad Politécnica de Valencia
Dirigida por: Dr. Carmelo López del Rincón (Universidad Politécnica de Valencia) y Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: Tesis de Master

Desarrollo de un vector para la expresión simultánea de múltiples proteínas en plantas basado en el potyvirus del grabado del tabaco.
Año: 2011
Nombre: Bedoya Rojas, Leonor Cecilia
Universidad: Universitat Politecnica de Valencia
Dirigida por: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: Tesis Doctorales

Caracterización de actividades RNA ligasa implicadas en la replicación de los viroides nucleares y cloroplásticos.
Año: 2011
Nombre: Nohales Zafra, María Ángeles
Universidad: Universitat Politecnica de Valencia
Dirigida por: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia) y Dr. Ricardo Flores Pedauyé (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia)
Tipo: Tesis Doctorales

Anàlisi molecular de la malastía de les fulles trencadisses de la palmera de dàtils: RNA, proteïnes i bacteries de la rizosfera.
Año: 2011
Nombre: Marqués Signes, Jorge
Universidad: Universitat de València
Dirigida por: José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia) y Dra. Nuria Durán-Vila (Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias, Moncada).
Tipo: Tesis Doctorales

Desarrollo de un vector viral desarmado para la coexpresión de proteínas heterólogas en planta
Año: 2011
Nombre: Rubio Lorente, Laura
Universidad: Universidad Politécnica de Valencia
Dirigida por: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia). Tutor: Dr. Carmelo López del Rincón (COMAV, Universidad Politécnica de Valencia)
Tipo: Trabajos de Fin de Carrera

Etiquetado de proteínas del virus del grabado del tabaco
Año: 2010
Nombre: Ruiz Valdés, Marta
Universidad: Universidad Politécnica de Valencia
Dirigida por: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: Tesis de Master

Construcción de clones infecciosos y estables del virus del grabado del tabaco (TEV)
Año: 2010
Nombre: Bedoya Rojas, Leonor Cecilia
Universidad: Universidad Politécnica de Valencia
Dirigida por: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: Tesis de Master

Evolució molecular de la proteïna HC-Pro del TEV, supressor del silenciament de l’RNA
Año: 2009
Nombre: Torres Barceló, Clara
Universidad: Universitat de València
Dirigida por: Dr. Santiago Francisco Elena Fito (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia) y Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: Tesis Doctorales

RNA ligasas nucleares y cloroplásticas: posible papel en la replicación de los viroides
Año: 2008
Nombre: Molina Serrano, Diego
Universidad: Universitat de València
Dirigida por: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia) y Dr. Ricardo Flores Pedauyé (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia)
Tipo: Tesis Doctorales

Replicación de los viroides nucleares: motivos estructurales y enzimas implicados en el procesamiento in vivo de sus intermediarios oligoméricos
Año: 2007
Nombre: Gas López, María Eugenia
Universidad: Universitat de València
Dirigida por: Dr. Ricardo Flores Pedauyé (IBMCP, CSIC- Universidad Politécnica de Valencia), Cármen Hernández Fort (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia) y Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: Tesis Doctorales

Análisis por mutación insercional del procesamiento de los RNAs del viroide latente de la berenjena en el cloroplasto de Chlamydomonas reinhardtii.
Año: 2007
Nombre: Martínez García, Fernando
Universidad: Universidad de Valencia
Dirigida por: Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia) y Dra. María Luisa Salvador Alcober (Departamento de Bioquímica y Biología Molecular, Universidad de Valencia).
Tipo: Tesis de Master

Identificación y caracterización de pequeños RNAs en palmera datilera y berenjena
Año: 2001
Nombre: Fadda, Ziad Ghaleb Nimer
Universidad: Universitat Politecnica de Valencia
Dirigida por: Dra. Nuria Durán-Vila (Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias, Moncada), Dr. José Antonio Darós Arnau (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia) y Dr. Ricardo Flores Pedauyé (IBMCP, CSIC-Universidad Politécnica de Valencia).
Tipo: Tesis Doctorales

Gallery

Biotecnología de Virus de Plantas
Biotecnología de Virus de Plantas

Linkedin Twitter Youtube
IBMCP logo 10
Menu
  • About Us
    • About Us
    • Management & Organisation
    • Facts & Figures
    • Inclusive Science
  • Staff
    • Staff Researchers
    • Career Track Fellows
    • Postdoctoral Researchers
    • Predoctoral Researchers
    • Management
    • Services
    • Former Members
  • Research
    • Research Departments
    • Research Groups
    • Publications
  • Services
    • DNA Sequencing And Gene Expression Analysis
    • Metabolomics
    • Microscopy
    • Plant Hormone Quantification
    • Proteomics
    • Genomics
    • Bioinformatics
  • Newsroom
    • Latest News
    • Outreach
    • Press Room
    • Media Resources
  • Education
    • Master’s Degree
    • All BDT/MDT Offers
  • Seminars And Events
    • Seminars
    • Events
  • Join Us
    • HR Strategy
    • Active Job Offers

Ingeniero Fausto Elio, s/n
46022 Valencia · Spain
Tel. +34 963 877 856
Fax. +34 963 877 859

© 2021 IBMCP · Aviso Legal

General Search
Search Research Group
Search Publications
General Search

Search Research Group

Search Publications