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Trabajos Fin de Master Ofertados por el IBMCP 2021

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Los DNA circulares son una forma habitual y estable de ácidos nucleicos, encontrándose como genomas de la
mayoría de organismos procariotas, orgánulos o fagos. Sin embargo, los RNAs circulares han sido considerados
como moléculas muy inusuales hasta recientemente. En nuestro laboratorio hemos descrito la existencia de
diversos transposones de plantas y animales que se expresan como RNAs circulares con dominios catalíticos o
ribozimas. Más recientemente, hemos descubierto novedosas familias de virus de RNA circular distribuidas en
muestras medioambientales por todo el planeta, confirmando la ubicuidad de este tipo de macromolécula. En
el contexto de una pandemia mundial ocasionada por un virus de RNA como el SARS-CoV2, el desarrollo de
nuevas estrategias para luchar contra esta y futuras enfermedades virales es inevitable. En este TFM se
avanzará en el desarrollo de nuevas herramientas biotecnológicas basadas en RNAs circulares con ribozimas
dirigidos contra genomas virales de RNA, así como contra mRNAs de genes endógenos que se desee degradar.
Utilizando inicialmente aproximaciones in vitro, se estudiarán diversas construcciones de RNAs circulares
diseñados contra las dianas de interés. Posteriormente, las construcciones con mejores resultados se
trasladarán a sistemas vegetales modelo (N. benthamiana y A. thaliana) mediante transformación genética, así
como en ensayos de transfección en cultivos celulares. Todos estos trabajos, además de su interés básico y
aplicado, permitirán al estudiante llegar a dominar las técnicas multidisciplinares empleadas en nuestro
laboratorio, en las que fundamentalmente se combinan las aproximaciones bioinformáticas y genómicas con la
biología molecular y estructural de ácidos nucleicos.

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